Tobias Kaiser studierte in der Toskana bei seinem Vater Georg Kaiser (ehem. Flötist der Deutschen Oper Berlin) und absolvierte sein Diplom am Istituto superiore di studi musicali Pietro Mascagni in Livorno. Anschließend studierte er am Richard-Strauss-Konservatorium München bei Sara Vargas-Barritt und Philippe Boucly (Soloflötist BRSO). 1998 spielte Kaiser am Stadttheater Passau, 1999 gründete er das Kammerensemble Arte Viva. Große Erfolge feierte Kaiser mit seiner solistischen Tätigkeit im In- und Ausland, welche außer Kammerkonzerten auch zahlreiche Konzerte für Flöte und Orchester umfasst, so z.B. Jacques Iberts Flötenkonzert mit der Württembergischen Philharmonie Reutlingen. Seit 2007 ist er Flötist der Taschenphilharmonie in München und hat hier auch bei vielen CD-Einspielungen mitgewirkt. Als Mitbegründer und Flötist des Ensemble Zeitsprung, 2020 fusioniert zu dem Ensemble der/gelbe/klang widmet sich Kaiser intensiv den Ausdrucksformen der zeitgenössischen Musik und arbeitet hier mit Komponisten wie Rodion Shchedrin, Huang Ruo oder Wilfried Hiller zusammen.